Die Geschichtswerkstatt Jena entstand als Verein symbolträchtig am 17.06.1995. Zugrunde lag eine Empfehlung der Enquete-Kommission des Deutschen Bundestages zur Aufarbeitung der SED-Diktatur, die Geschichte des Widerstandes außeruniversitär aufzuarbeiten.
Neben der Herausgabe der Zeitschrift „Gerbergasse 18“ veranstaltet die Geschichtswerkstatt Vorträge zur DDR-Geschichte, begleitet Schüler und Studenten bei Projektarbeiten, es gibt Autorenlesungen und sowie zahlreiche andere Aktivitäten zur Durchleuchtung der Machtstrukturen im SED-Staat.